基金的交易成本和時間成本要高於股票。股票雙向交易一次要有單向印花稅0.1%，傭金、手續費和交易規費0.2%左右，交易成本0.3%左右，最短時間成本約3天，（T日買。T+1才可以賣。T+2資金可回籠到賬使用。）
基金手續費主要包括申購費和贖回費，其他間接費用計入基金運營成本，在基金凈值中已扣除，屬於隱形成本不予考慮，申購費正常1-1.5%，贖回費0.5-1%左右，雙向交易成本約2%左右，申購和贖回到賬分別需要3——5天，合計約8天，且不含節假日。時間和交易成本都很高，所以不宜短線交易，長期投資為好。
股票手續費包括：
1、印花稅是投資者在股票交易完成之後，需要向國家繳納的稅收，稅率為股票交易實際成交金額的1‰，是全國統一的。需要注意的是，印花稅只向股票交易中的賣方單方收費，債券和基金交易免收印花稅。
2、過戶費則是指股票成交後，更換戶名所產生的費用，只有上交所需要支付，費率為成交金額的0.2‰。而這里的成交金額是指股票交易的股數，而非金額。
3、證券交易經手費是指證券公司在交易所完成股票交易後，按照實際成交金額的一定比例支付給證券交易所的交易費用。從2015年8月1日開始，證券交易經手費費率從0.0696‰變為0.0487‰，採取雙邊收取。
4、傭金，不同的證券公司收費比例不同，但最高都不超過3‰。傭金最低收費標准為5元，因此單筆交易傭金不足5元的，則按照5元收取。
基金手續費:
1、基金銷售過程中發生的由基金投資者自己承擔的費用（交易費用），主要包括認購費、申購費、贖回費及基金轉換費，這部分費用直接從投資者認購、申購、贖回或轉換的金額中收取。
2、基金管理過程中發生的由基金資產承擔的費用（運作費用），主要包括基金管理費、託管費等。
根據證監會發布的「流動性新規」，2018年4月1日起，基金管理人應當強化對投資者短期投資行為的管理，對除貨幣市場基金與交易型開放式指數基金以外的開放式基金，對持續持有期少於7天的投資者收取不低於1.5%的贖回費（懲罰性費用），並將上述贖回費全額計入基金財產。